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約24時間周期で体内の生理機能を調節する内因性の時計機構。視床下部の視交叉上核を中心に、CLOCK・BMAL1・PER・CRYなどの時計遺伝子が転写・翻訳のフィードバックループで自律的に時間を刻む。2017年ノーベル生理学・医学賞の受賞対象となった。
ラテン語「circa diem（約一日）」に由来する、ほぼ24時間周期の内因性リズム。視交叉上核（SCN）を中枢時計として、睡眠・体温・ホルモン分泌・免疫機能を時間的に整合させる。光が最強のリセット因子で、社会的時差ぼけ（ソーシャルジェットラグ）は慢性疾患リスクと相関する。