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脊椎動物が備える多層的な生体防御システム。病原体・異物を「非自己」として認識し排除する。大きく自然免疫(即時・非特異的)と適応免疫(記憶・特異的)に分かれ、T細胞・B細胞・抗体・補体などが協調して機能する。過剰反応はアレルギーや自己免疫疾患を引き起こす。